From 74dfedec557840fb92b580fbf44b4f43dcc51ea1 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Javier Rodriguez Vidal Date: Fri, 19 Feb 2021 11:27:04 +0000 Subject: [PATCH] Update readme --- UMLS_Extractor/readme | 7 +++++++ 1 file changed, 7 insertions(+) diff --git a/UMLS_Extractor/readme b/UMLS_Extractor/readme index e69de29..7afd47d 100644 --- a/UMLS_Extractor/readme +++ b/UMLS_Extractor/readme @@ -0,0 +1,7 @@ +Carpeta que contiene el código para la extracción de conceptos UMLS + CUI + + - Config.ini --> archivo de configuración para la conexión a BBDD + - extractor.py --> main. Recibe dos parámetros de entrada: fichero de anotaciones y output para guardar los datos + - ConceptExtractor.py --> script que permite extraer los conceptos encontrados por BERT así como: la entidad asociada, su posición de inicio y fin en el texto + - jkesExtractor.py --> script que busca si conceptos encontrados se encuentran en JKES o no. En el caso de encontrarlos, devuelve el CUI que tienen. + - umlsExtractor.py --> script que recibe los conceptos no encontrados en JKES y recupera en el metatesauro de UMLS el concepto más similar (usando distancia Levenshtein) y el CUI asociado \ No newline at end of file -- 2.24.1