Update enfermedades neurológicas.ipynb

análisis/network medicine/enfermedades neurológicas.ipynb

@@ -42,10 +42,10 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#nodos\n",
-    "pro = pd.read_csv('Data/Nodes/pro.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "gen = pd.read_csv('Data/Nodes/gen.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "dru = pd.read_csv('Data/Nodes/dru.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "dis = pd.read_csv('Data/Nodes/dis.tsv', sep=\"\\t\")"
+    "pro = pd.read_csv('data/nodos/pro.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "gen = pd.read_csv('data/nodos/gen.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "dru = pd.read_csv('data/nodos/dru.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "dis = pd.read_csv('data/nodos/dis.tsv', sep=\"\\t\")"
    ]
   },
   {
@@ -56,12 +56,12 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#links\n",
-    "pro_pro = pd.read_csv('Data/Links/pro_pro.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "dis_gen = pd.read_csv('Data/Links/dis_gen.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "dse_sym = pd.read_csv('Data/dse_sym_limpio.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "dis_dru_the = pd.read_csv('Data/Links/dis_dru_the.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "gen_pro = pd.read_csv('Data/Links/gen_pro.tsv', sep=\"\\t\")\n",
-    "dru_pro = pd.read_csv('Data/Links/dru_pro.tsv', sep=\"\\t\")"
+    "pro_pro = pd.read_csv('data/links/pro_pro.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "dis_gen = pd.read_csv('data/links/dis_gen.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "dse_sym = pd.read_csv('data/dse_sym_limpio.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "dis_dru_the = pd.read_csv('data/links/dis_dru_the.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "gen_pro = pd.read_csv('data/links/gen_pro.tsv', sep=\"\\t\")\n",
+    "dru_pro = pd.read_csv('data/links/dru_pro.tsv', sep=\"\\t\")"
    ]
   },
   {
@@ -103,7 +103,7 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#cargo el archivo\n",
-    "spl = pd.read_csv('Archivos/SPL PPI.csv', index_col='Source')"
+    "spl = pd.read_csv('archivos/SPL PPI.csv', index_col='Source')"
    ]
   },
   {
@@ -668,7 +668,7 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#cargo los datos de los nodos en la red PPI\n",
-    "datos_gppi = pd.read_csv('Archivos/Datos_Gppi.csv', sep=\",\") "
+    "datos_gppi = pd.read_csv('archivos/Datos_Gppi.csv', sep=\",\") "
    ]
   },
   {
@@ -679,7 +679,7 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#cargo los símbolos de los genes\n",
-    "sim = pd.read_csv('Archivos/protein_gene_symbol.csv', sep=\",\")"
+    "sim = pd.read_csv('archivos/protein_gene_symbol.csv', sep=\",\")"
    ]
   },
   {
@@ -752,7 +752,7 @@
    ],
    "source": [
     "#Imagen realizada en gephi\n",
-    "Image(filename=\"Módulos/Módulo Demencia.png\")"
+    "Image(filename=\"módulos/Módulo Demencia.png\")"
    ]
   },
   {
@@ -783,7 +783,7 @@
    ],
    "source": [
     "#Imagen realizada en gephi\n",
-    "Image(filename=\"Módulos/Módulo Bipolar.png\")"
+    "Image(filename=\"módulos/Módulo Bipolar.png\")"
    ]
   },
   {
@@ -814,7 +814,7 @@
    ],
    "source": [
     "#Imagen realizada en gephi\n",
-    "Image(filename=\"Módulos/Módulo Epilepsia.png\")"
+    "Image(filename=\"módulos/Módulo Epilepsia.png\")"
    ]
   },
   {
@@ -845,7 +845,7 @@
    ],
    "source": [
     "#Imagen realizada en gephi\n",
-    "Image(filename=\"Módulos/Módulo Esquizofrenia.png\")"
+    "Image(filename=\"módulos/Módulo Esquizofrenia.png\")"
    ]
   },
   {
@@ -1010,10 +1010,10 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#cargo los archivos de proximidades aleatorias\n",
-    "proximity_dementia_rand= pd.read_csv('Archivos/Proximity random Demencia.csv', sep=\",\")\n",
-    "proximity_bipolar_rand= pd.read_csv('Archivos/Proximity random Bipolaridad.csv', sep=\",\")\n",
-    "proximity_epilepsy_rand= pd.read_csv('Archivos/Proximity random Epilepsia.csv', sep=\",\")\n",
-    "proximity_schizo_rand= pd.read_csv('Archivos/Proximity random Esquizofrenia.csv', sep=\",\")"
+    "proximity_dementia_rand= pd.read_csv('archivos/Proximity random Demencia.csv', sep=\",\")\n",
+    "proximity_bipolar_rand= pd.read_csv('archivos/Proximity random Bipolaridad.csv', sep=\",\")\n",
+    "proximity_epilepsy_rand= pd.read_csv('archivos/Proximity random Epilepsia.csv', sep=\",\")\n",
+    "proximity_schizo_rand= pd.read_csv('archivos/Proximity random Esquizofrenia.csv', sep=\",\")"
    ]
   },
   {
@@ -1062,7 +1062,7 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#cargo el archivo\n",
-    "resultado_proximidad= pd.read_csv('Archivos/Resultados proximidad.csv', sep=\",\")"
+    "resultado_proximidad= pd.read_csv('archivos/Resultados proximidad.csv', sep=\",\")"
    ]
   },
   {
@@ -1188,7 +1188,7 @@
    "outputs": [],
    "source": [
     "#cargo el archivo obtenido en la celda anterior\n",
-    "resultados_proximidad_targets = pd.read_csv('Archivos/Resultados proximidad y targets en módulo.csv', sep=\",\")"
+    "resultados_proximidad_targets = pd.read_csv('archivos/Resultados proximidad y targets en módulo.csv', sep=\",\")"
    ]
   },
   {